По итогам 1998 года МАИ занял первое место среди машиностроительных и авиационных вузов России.
На базе МАИ проведена (с 16 по 21 августа) 2-я Международная конференция «Дифференциальные и функционально-дифференциальные уравнения», в которой приняли участие известные математики более чем из 15 стран. Организаторы конференции – Московское математическое общество, Математический институт РАН им. Стеклова и МАИ, председатель оргкомитета – проректор МАИ по научной работе профессор В.Г. Веретенников.
19 декабря МАИ получил сертификат типа Госавиарегистра Межгосударственного авиационного комитета на сверхлегкий самолет «Авиатика-МАИ-890».
Указом Президента РФ № 1048 от 16 августа за большой вклад в развитие отечественной науки и подготовку высококвалифицированных кадров ректор МАИ, член-корреспондент РАН, профессор А.М. Матвеенко награжден орденом «За заслуги перед Отечеством» IV степени.
Указом Президента РФ № 1307 от 29 сентября присуждена Государственная премия РФ 1999 года в области науки и техники: Н.П. Горюнову, заместителю главного конструктора отраслевого специального конструкторского бюро экспериментального самолетостроения (ОСКБЭС); В.Ю. Дёмину, заместителю главного конструктора ОСКБЭС; В.М. Фейгенбауму, заместителю главного конструктора ОСКБЭС; А.М. Матвеенко, ректору МАИ; П.П. Огаджанову, директору экспериментального опытного завода; Г.М. Немову, генеральному директору государственного унитарного предприятия «МАПО МиГ»; О.П. Чуканцеву, заместителю технического директора того же предприятия; К.М. Жидовецкому, главному конструктору ОСКБЭС (посмертно), – за разработку и внедрение в производство и эксплуатацию семейства сверхлегких многоцелевых самолетов.
Премия Правительства РФ в области науки и техники за 1998 год (постановление № 306 от 17 марта 1999 года) присуждена профессору (каф. № 106) В.А. Леонову за учебник «Летные испытания самолетов» (в соавторстве).